全长转录组测序

            转录组是细胞或组织内全部RNA转录本的集合,它反映着不同的生命阶段、不同的组织类型、不同的生理状态以及不同的环境条件下表达的基因。转录组的研究可以从整体上揭示细胞中基因的表达情况及调控规律。第二代测序技术由于读长限制,无法提供转录本的全貌及可变剪接等重要信息,因而大大制约了转录组数据的深度利用。

            金唯智引进Pacbio Sequel测序平台,具有长读长,可以测通完整转录本,无需测序后的拼接和组装,直接读出全长转录本的基因结构等信息,从而获得可变剪接、融合基因、新转录本、新内含子等信息。


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            全长转录组测序服务的优势

            无需拼接和组装,直接获取全长转录本
            发现新转录本,新的可变剪切组合
            一次性测出可变剪切、融合基因、单碱基突变等

            服务参数


            生物信息学分析

             

            注:*为高级分析服务,需基于同一样本的二代数据

            金唯智可根据您的需求提供个性化的高级分析服务,详情请联系金唯智技术支持沟通项目细节。

             

             

            服务参数

             样品要求 建库步骤  测序策略 
            • 3-5µg高质量Total RNA
            • OD260/280>2,RIN值>9
            • 核酸浓度大于500ng/µl
            • RNA样品 QC
            • 制备全长cDNA
            • PCR扩增
            • cDNA片段分级建库
            • 采用Pacbio Sequel平台,每个样品片段长度分级构建2-4个测序文库
            • 根据数据量要求,在一个SMRT cell上测一个火同时测多个文库
                   

            注:金唯智可根据客户对病毒量的需求,可提供病毒量109TU,滴度 ≥109TU/ml的病毒。

             

            RNA干扰慢病毒包装

             服务介绍 标准交付 
            • 双链RNA可以高效特异地阻断体内特定基因表达, 促使mRNA降解,诱使细胞表现
              出特定基因缺失的表型, 称为RNA干扰(RNA interference, RNAi).利用RNA干扰机
              制可以实现细胞中基因的敲除。
            • 金唯智根据客户提供的基因 信息和服务需求,设计该基因高效的siRNA靶点,或是
              客户直接提供已经设计好siRNA 靶点,金唯智制定符合客户要求的方案,构建干扰
              慢病毒载体,包装的病毒颗??捎? 于细胞实验和动物实验。
            • 病毒量108TU,滴度≥108TU/ml
            • 对照病毒200ul,滴度≥108TU/ml
            • 病毒QC报告(含滴度检测和无菌检测)
            • 冻干的病毒质粒4ug和质粒QC文件
                   

            注:金唯智可根据客户的对病毒量的需求,可提供病毒量109TU,滴度 ≥109TU/ml的病毒。

            高通量测序平台

            金唯智的高通量测序平台包括Illumina  NovaSeq,HiSeq X Ten,HiSeq,MiSeq,PacBio Sequel、10X Genomics及MGISEQ-2000。
            可提供多种测序读长、通量和时间周期选择,满足各类科研及应用需求对成本和速度的差异化需求。
            如需了解不同NGS平台的更多相关信息以及推荐平台的规格说明,请访问高通量测序平台页面。

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