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          16S/18S/ITS测序及宏基因组测序


          16S宏基因组测序常常采用高通量扩增子测序技术来检测微生物16S rRNA基因的特定高变区。16S MetaVx™是金唯智公司独立研发的微生物菌群高通量测序平台,适用于环境微生物、肠道菌群等样品的细菌和古细菌相对丰度的鉴定。16S MetaVx™体系采用多套引物同时扩增细菌和古细菌的V3、V4和V5 三个可变区,大幅提高当前16S宏基因组学技术的灵敏度和特异性。与常用的16S宏基因组学检测方法相比,16S MetaVx™能够检测出更多的痕量的细菌和古细菌。

          除了细菌和古菌的高通量检测,金唯智也提供针对真菌和原生生物的菌群检测服务,主要包括ITS测序和18S测序两种。18S测序主要鉴定真菌及其他原生生物,适用于浮游微生物、土壤微生物等环境微生物,以及共生的真核生物菌群等。而ITS测序主要鉴定真菌,如果样品以真菌为主,或者仅关注样品中的真菌菌群,可以选择ITS测序。请联系金唯智获得关于ITS测序和18S测序的详细信息。


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          服务选项

          • 16S MetaVx? (不含真核生物) 

            环境样品16S MetaVx?测序,使用两个扩增子检测16S基因的V3、V4和V5三个可变区,其中一个扩增子分析V3/V4区,另一个扩增子分析V4/V5区。该项服务适于检测真核生物DNA含量较低的样品。

          • 16S MetaVx? (含真核DNA)

            哺乳动物16S MetaVx?测序,采用一个扩增子检测16S基因的V3和V4可变区。该项服务适于检测真核生物DNA含量较高的样品,此扩增体系去掉了与真核18S基因同源性较高的V5区。

          服务优势



          结果更真实:多套引物设计,同时检测细菌和古细菌,真实反映菌群组成


          检测区域更多:同时检测V3、V4和V5 三个可变区,显著提高检测能力


          读长更长:MiSeq(PE300)测序,大幅提高测序读长和检测的准确性


          数据量更大:不低于5万 reads/样品, 保证检测到样品中的痕量微生物


          方案灵活多变:多套引物和实验方案,全面解决细菌、古菌、真菌的各类检测需求,能检测真核生物DNA含量较高的样品


          周期更短:采用MiSeq测序,方便快捷,最短20个工作日交付检测报告


          价格更实惠:流程化实验操作,节省您的每一分科研经费

          技术细节

          相对于目前已有的宏基因组16S鉴定平台,金唯智开发的16S MetaVx™测序平台兼具保守性和灵活性,能够覆盖绝大部分细菌菌群,并同时鉴定细菌和古菌。比常规的16S检测更加灵敏,并且更能反映真实的菌群组成和结构。
          使用16S MetaVx™测序平台和常用的16S V4区高通量测序平台,在相同条件下,同时对相同的样品进行扩增测序。测序完成,将数据进行归一化。比对结果如下:

          • 图1 16S MetaVx™ Vs 常规16S测序

            模拟测试样品,16S MetaVx™平台检测出19个纲的微生物,而常规16S测序仅检测出11个纲。*仅被16S MetaVx™平台检出。**占菌群80%左右,上图未包含。

          • 图2 增加V5区显著提高菌种检出率

            16S MetaVx™测序平台增加了V5可变区检测,能够比单单检测V3V4可变区在不同的物种分类层级上多鉴定出10-15%的菌种。

          金唯智16S/18S/ITS测序及宏基因组测序流程

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            实验设计


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          • 目标区域富集
            &文库制备

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            高通量测序


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          • 微生物特性分析


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          金唯智宏基因组学样品提交指南

          金唯智的宏基因组学项目可以针对土壤、粪便、空气、水体、动植物体表和体内等任何来源提取的全基因组DNA进行检测,除了已纯化的基因组DNA,也可以提供土壤、粪便、液体和组织等样品。如需获得更详细的样品提交要求,请访问我们的样品提交指南页面。

           

          金唯智16S/18S/ITS测序及宏基因组测序服务标准交付

          • 原始数据(FASTQ格式)     • 项目结题报告

          高通量测序平台

          金唯智的高通量测序平台包括Illumina  NovaSeq,HiSeq X Ten,HiSeq,MiSeq,PacBio Sequel、10X Genomics及MGISEQ-2000。
          可提供多种测序读长、通量和时间周期选择,满足各类科研及应用需求对成本和速度的差异化需求。
          如需了解不同NGS平台的更多相关信息以及推荐平台的规格说明,请访问高通量测序平台页面。

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